2024年7月，杜克大学Nicholas Morffy等东说念主在Nature杂志上发表了题为 “Identification of plant transcriptional activation domains”的著作，该商讨基于植物激活域结构恣意实验(PADI)和神经网罗模子(TADA)澳门六合彩资料库，揭示了植物转录因子ADs结构域的序列特征，并通过滋长素反馈因子分析考证了ADs的保守性。

转录因子(Transcription factors, TFs)一般含有DNA聚合结构域和转录激活扣构域(Activation domains，ADs)，通过绑定DNA序列和招募进展转录激活或扼制功能的分子伴侣进展作用。

著作东要践诺概括

植物激活扣构域恣意实验

神经网罗模子构建

PADI和TADA灵验性考证

ADs的进化保守性讨论

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商讨东说念主员取舍酵母高通量抒发的计策，从数千个转录因子中恣意出了1553个ADs，这些ADs在不同转录因子眷属中散播并不均匀，无数定位在卵白的N或C结尾，在结构上倾向于内在无序区域。

图1.已恣意ADs的拟南芥转录因子

图2.拟南芥转录因子高通量筛效果

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该商讨基于42个序列特征和深度学习，诞生出神经网罗模子TADA，为IDRs卵白与其序列模块之间的生物物理模子和网罗研究性提供了分析框架，并恣意出了6个要道序列结构模块，为后续进一步商讨ADs的要道模块提供基础。

图3.欺骗激活域序列特征构建瞻望模子

图4.六种不同的序列特征的不同的构成偏好

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商讨欺骗拟南芥中9个长度小于100aa的ADs进行了功能商讨，并对拟南芥滋长素反馈因子(Auxin Response Factor，ARF)眷属23个成员进行测定，发现PADI不错用来恣意一个特定转录因子眷属的ADs区域，何况能在不同细胞和组织类型中检测ADs，进行功能分散。

图5.已恣意激活域的考证

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商讨采取11种着花植物ARF基因的A分支进行了分析，效果显现ADs的功能不仅跟序列研究还跟其所处位置研究，同期讲明了拟南芥中诞生的PADI瞻望系统相同适用于其它着花植物，揭示了ADs的功能和结构位点在进化中的保守性。

图6. ARF 眷属中激活域的进化规章商讨

要而论之，商讨给与酵母文库筛选的轮番澳门六合彩资料库，在卵白水平上恣意拟南芥转录因子的转录激活扣构域，构建了神经网罗瞻望模子，不错精确瞻望转录激活扣构域并识别招募共激活因子，为讨论转录激活扣构域提供了有劲器具。

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